Les deux coupoles au-dessus de la ligne des toits sont la première chose que l'on voit, et elles sont le résultat d'une église qui s'est retournée deux fois. L'Igreja de São Francisco est ce qui reste du plus ancien couvent de Tavira, fondé par les franciscains hors de l'enceinte de la ville à la fin du XIIIe siècle ou au début du XIVe. Les tremblements de terre de 1722 et 1755, un effondrement vers 1840 et un incendie dû à la foudre en 1881 ont emporté l'essentiel de l'église conventuelle gothique. Il reste la voûte d'ogives de la sacristie et deux chapelles gothiques, ouvertes dans le jardin voisin. Le reste est le remaniement du XIXe siècle, et c'est lui qui fait que l'endroit mérite qu'on s'arrête devant. Peu d'églises montrent aussi clairement ce qu'une confrérie de laïcs a fait d'une ruine.
Personne ne sait quand les franciscains sont arrivés à Tavira. Le couvent manque dans le registre de l'ordre de 1272 et apparaît pour la première fois dans un nouveau registre de 1330. Une chronique franciscaine dit que les templiers ont fondé la maison. Une meilleure histoire que la vraie, mais aucun document ne l'appuie. Damião de Vasconcelos a appelé le couvent, en 1881, "o mais antigo do Algarve", et cela tient. Il se trouvait hors de l'enceinte, avec son portail principal tourné vers l'ouest, vers ce qui est aujourd'hui le jardin.
Entrez dans la sacristie. Le plafond est une voûte d'ogives sexpartite, réunie en une seule clé au-dessus de chapiteaux à feuillages, apparentée aux tailleurs de pierre du monastère de Batalha au XVe siècle. Certains supposent que la pièce était la salle capitulaire. Dehors, dans le jardin, se dressent deux chapelles gothiques sans toit : la Capela dos Machados, de la fin du XIVe siècle, avec des marques de tâcherons, et la Capela dos Costas, du XVe siècle, liée au marchand Luís Afonso Painho vers 1458. Des chapelles funéraires pour les négociants de la ville, pas pour la noblesse.
En 1517, D. Manuel réforma le couvent et fit placer ses armes et la sphère armillaire dans la voûte du chœur. Au XVIe siècle, l'église abrita la confrérie qui devint la Santa Casa da Misericórdia, et à la fin du XVIIe siècle la confrérie de laïcs Ordem Terceira de São Francisco prit possession du transept. En 1743, Francisco Pereira construisit la Casa do Despacho de la confrérie. Puis vinrent les tremblements de terre de 1722 et 1755. En 1758, le couvent n'était toujours pas réparé.
Quand les ordres furent supprimés en 1834, l'église échut à l'Ordem Terceira. Vers 1840 ou 1843, une partie de la nef s'effondra. La confrérie abandonna la nef, ouvrit une porte là où s'était trouvé l'autel et tourna l'entrée vers la caserne Quartel da Atalaia. En 1844, la commune acheta le terrain de la nef pour en faire le cimetière de la ville. En 1881, la foudre frappa et l'église brûla. En 1884, on la retourna de nouveau, cette fois avec l'entrée depuis la place par le bras nord du transept. D'où la coupole sur la croisée et la coupole à lanternon sur l'ancien chœur. À l'intérieur : retable baroque et six niches avec des figures de procession.
Le portail principal donne au nord, sur la Praça Zacarias Guerreiro, que l'église partage avec l'Igreja de São José do Hospital. Le jardin voisin est municipal et ouvert ; les deux chapelles gothiques s'y dressent à l'air libre. En 2025, la commune et l'Ordem Terceira ont convenu d'une restauration des toits, des façades et du clocher pour 1,27 million d'euros, attendez-vous donc à des échafaudages. La Procissão dos Passos, à Pâques, part d'ici.
Les ordres mendiants bâtissaient là où il y avait de la place et des gens, et c'était hors de l'enceinte de la ville. Le couvent se trouvait hors des murs, avec sa porte principale vers l'ouest, et la ville a grandi autour de lui. Le terrain a changé d'usage chaque fois que la ville en a eu besoin : cimetière à partir de 1844, parce que l'ancien, dans le château, devait être remplacé, jardin après 1918. Le jardin fait environ 1 800 mètres carrés, et les chapelles s'y dressent comme des meubles d'une maison qu'on a démolie.
L'église n'est pas classée. Le dossier a été ouvert en 2020 et figurait encore en 2024 comme "em vias de classificação". On comprend l'hésitation. Le gothique est peu de chose, le reste est du rafistolage du XIXe siècle. Mais c'est aussi tout l'intérêt. On se tient dans un bâtiment retourné deux fois par une confrérie qui a rapiécé et remanié au lieu de repartir de zéro. La restauration de 2025 porte sur les toits, les façades et le clocher, et l'ordre s'est engagé à garder l'église ouverte aux visiteurs pendant au moins dix ans.