Le portail est ce pour quoi l'on vient. André Pilarte, maître maçon passé par le chantier des Jerónimos à Lisbonne, le tailla pour la confrérie de la Miséricorde selon un contrat de 1541 qui exigeait un portail "à la vraie romaine". C'est la Renaissance en Algarve, tôt et mieux que la plupart ; Haupt, cité dans l'inventaire de l'État, l'a qualifié de meilleur exemple de la Renaissance dans tout l'Algarve. L'église derrière fut achevée en 1552, a trois nefs, ce qui est rare pour une église de Misericórdia, et est couverte à l'intérieur de bois sculpté doré de 1722 et d'azulejos bleus et blancs de 1760. La confrérie la possède toujours et l'a ouverte comme musée en 2010.
La confrérie date d'environ 1498. Le 24 novembre 1541, elle passa contrat avec "mestre André Pilart" pour une église neuve, et le contrat dit ce qu'elle doit avoir : "son portail de pierre de taille à la vraie romaine, un portail honorable, comme il convient à une œuvre telle que celle-ci". Pilarte habitait Tavira et dirigeait le plus important atelier de taille de pierre de la ville au milieu du XVIe siècle. La partie haute du portail vint avec un nouveau contrat en 1551, alors que l'église était déjà achevée, en même temps que la sacristie et la Casa do Despacho. En août 1552, tout était terminé. Le contrat portant la signature de Pilarte se trouve toujours dans les archives de la confrérie.
À l'intérieur, c'est une halle sur colonnes en quatre travées, et les chapiteaux ne sont pas identiques ; ils se répartissent en cinq modèles dans le style fantaisiste du temps de João III. Le premier maître-autel fut posé en 1559. En 1722, on fit faire au sculpteur sur bois local Manuel Abreu do Ó un nouveau maître-autel et deux autels latéraux en talha dorée. Puis vinrent les carreaux. L'année est peinte près de l'autel latéral de Nossa Senhora da Conceição, "ANNO de 1760", et les panneaux venus de Lisbonne montrent les quatorze œuvres de miséricorde, les corporelles du côté de l'Épître et les spirituelles du côté de l'Évangile, plus des scènes de la vie du Christ. Quant à savoir qui les a peints, les sources ne sont pas d'accord.
Selon Turismo de Portugal, l'église servit d'église paroissiale après le tremblement de terre de 1755, jusqu'à ce que Santa Maria soit reconsacrée en 1800 ; les inventaires portugais n'en parlent pas. La République de 1910 mit fin aux processions de Pâques. Le classement vint en 1943, l'année même où les toits furent signalés en ruine. En 1958, le Povo Algarvio écrivit "A igreja da Misericórdia, suplica Misericórdia", et l'État répara toits, plafonds et façades jusqu'en 1970. Cette année-là, on confia l'église à la commune pour un musée d'art sacré qui ne vit jamais le jour. En 1981, la procession du Vendredi saint reprit, et en 2010 l'église ouvrit comme musée.
Placez-vous face au portail, pas de biais. Il regarde vers le sud, vers la rue qui mène à l'une des anciennes portes de la ville, pour qu'on puisse le voir de face, de loin. Dans les pilastres, des grotesques avec des coupes, des démons, des cygnes et des putti ; dans les arcs, des hippocampes, des sirènes, des aigles, des griffons et une figure avec une viole. Au-dessus de la corniche, une fenêtre ronde ; au-dessus encore, Notre-Dame de la Miséricorde sous un baldaquin, les armes royales à gauche, celles de la ville à droite et Pierre et Paul tout en haut. À l'intérieur : cherchez l'année 1760 près de l'autel de la Conceição. L'église et les anciennes salles du conseil, les Salas do Despacho, sont gérées comme musée par la Santa Casa ; les salles servent aux expositions.
Les églises sont orientées est-ouest. Celle-ci tourne sa façade vers le sud, vers la rue qui menait à une porte de la ville, et ce n'est pas de la négligence. L'inventaire de l'État y lit un geste délibéré de la Renaissance : l'église devait être vue de face et s'imposer dans la rue. Cela cadre avec le contrat, qui exige un portail "honorable", et avec Pilarte, qui avait vu ce qui se construisait à Lisbonne. Une petite ville de province reçut une façade à laquelle Haupt ne trouva pas d'équivalent en Algarve.
La plupart des églises de cet âge ont fini entre les mains de l'État ou de la paroisse. Celle-ci appartient toujours à la Santa Casa da Misericórdia de Tavira, qui y eut son siège jusqu'en 1986 et qui, selon Barlavento, détient les plus anciennes archives connues de la ville, avec des parchemins de 1425 et le contrat de Pilarte de 1541. La confrérie gère aujourd'hui des maisons de retraite, et l'église est son musée. Cela en fait moins un monument et plus un lieu de travail, un meilleur sort que le musée d'art sacré qui ne vit jamais le jour.